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CHARACTERISTIC

技术特点

  • 检测通量

一次性检测6-18个样本,大队列样本需每批加入1-2个相同样本作为内参;

  • 适用范围

擅长复杂样本定量分析,不适用于不同组织器官类型样本混合检测;

  • 重复性好

所有样本混合上机,同时进行质谱检测;

  • 缺失值少

为后续生物信息学分析提供丰富的数据;

  • 注意事项

具有比值压缩效应,蛋白质差异倍数有一定程度压缩。

APPLICATIONS

应用方向

ADVANTAGES

服务优势

服务选择多样

提供timsTOF HT、timsTOF Pro2、Orbitrap Astral、Orbitrap Exploris? 480、Q Exactive HF-X、Orbitrap Eclipse等多种质谱平台选择;

提供DIA、dDIA、LFQ、TMT等多种定量方法选择。

项目经验丰富

  • 项目经验涵盖多物种、多组织器官类型及多疾病类型,包括:

  • 100+种人类器官、组织、细胞及疾病类型;

  • 60+种小鼠器官、组织、细胞及疾病类型;

  • 60+种医学、农牧领域模式动物及非常见动物样本;

  • 60+种药物、农牧领域模式植物及非常见植物样本;

  • 60+种细菌、真菌等微生物样本。


项目文章丰富

与100+所医院、研究所等单位建立深度合作;

合作文章累积影响因子300+,发表于多部医学、生物学、植物等领域期刊。

  • 服务选择多样

  • 项目经验丰富

  • 项目文章丰富

MEASURED DATA

实测数据

皇家马德里中文官网3D定量蛋白质组实测数据

ANALYSIS PROCESS

分析流程

定量蛋白质组生信分析流程

RESULT DISPLAY

结果展示

定量蛋白质组结果展示

CLASSIC CASES

经典案例

合作文章|菟丝子与其寄主植物之间广泛的植物间蛋白质转移

发表期刊:Molecular Plant
影响因子:17.1
发表单位:中国科学院昆明植物研究所
发表时间:2019.12.05

查看详情
SAMPLE REQUIREMENTS

样本要求

样本类型送样量
动物组织常规组织(脑、心、肝、脾、肺、肾、肌肉等柔软组织)20 mg
坚硬组织(软骨、毛发)200 mg
植物组织柔软组织(木本植物的叶、花等,草本植物,藻类,蕨类植物)300 mg
坚硬组织(根、树皮、树枝,果实种子等)3 g
微生物常见细菌、真菌菌体(菌体沉淀)、精细胞50 μL
细胞悬浮/贴壁培养细胞(细胞计数/沉淀)5×106或20 μL
液体类血浆/血清(不去除高丰度)10 μL
血浆/血清(去除高丰度-伯乐)300 μL
血浆/血清(去除高丰度-TOP2/TOP14)50 μL
脑脊液(不去除高丰度)200 μL
脑脊液(去除高丰度-TOP2/TOP14)500 μL
卵泡液(不去高丰度)200 μL
卵泡液(去除高丰度-伯乐)、尿液,精液2 mL
淋巴液、关节液、穿刺液、腹水5 mL
唾液/泪液/乳汁1 mL
培养基上清(不能使用含血清的培养基)10 mL
FFPE每片厚度10 μm,面积1.5×2 cm10-15片
其他蛋白溶液(最佳Buffer是8M Urea)30 μg


FAQ

常见问题

  • TMT标记实验对样品有什么要求?

    TMT适用于相同组织的相对定量分析,不能进行有或无的鉴定,不能将不同的组织部位一起标记上机,不能将不用物种的样本一起上机,对蛋白总量需求较LFQ高。

  • TMT对仪器有哪些要求?

    TMT试剂标签之间的质量差额在0.006 Da左右,需要质谱二级分辨率在50k以上才能准确分辨出不同的报告离子,因此只有在高分辨质谱仪上才能完成标记定量实验。主流仪器有Thermo fisher公司的 orbitrap系列质谱仪。

  • TMT 标记试剂的结构?

    Thermo Scientific 串联质谱标签试剂Tandem Mass Tag(TMT) reagents专为通过串联质谱对不同样品中的蛋白质进行鉴定和定量而设计。一组标签试剂里的所有标签均带有相同的质量,由一个胺反应性的NHS 酯基团,间隔臂(质量调整区)和质量报告基团组成。


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