4D定量蛋白质组学基于timsTOF质谱检测平台,在传统3D蛋白质组学的保留时间(retention time)、质荷比(m/z)和离子强度(intensity)三个维度的分离基础上,增加了肽段的碰撞截面积(collision cross-section),即离子淌度(ion mobility)的分离,从而降低样本复杂度,大幅提高扫描速度和检测灵敏度,带来蛋白质组学在鉴定深度、检测周期、定量准确性等性能上的革命性提升。
先进的仪器平台
国内首装timsTOF HT质谱仪
卓越稳定性保证大队列数据产出
同一样本三次重复相关性高达99%,CV值低于5%,数据产出稳定
超快扫描速度和超高分辨率
采用全新的第四代TIMS-XR和更先进的数字转换技术,实现更高的鉴定深度
超宽浓度范围检测能力
上样范围从pg到μg,适合外泌体、FFPE石蜡切片、活检穿刺组织等临床微量样本广泛适用
临床大队列样本的疾病分型、生物标志物发现;生理、病理及感染免疫的机制研究;药物的研发与药效评估
动植物的生长发育、遗传育种及生态保护研究;生物对环境的适应及胁迫抗逆的机制研究;营养与饲料成分的分析与优化
食品营养价值与品质的分析鉴定;产品成分的分析与优化;食品安全的提升
项目经验涵盖多物种、多组织器官类型及多疾病类型,包括:
100+种人类器官、组织、细胞及疾病类型;
60+种小鼠器官、组织、细胞及疾病类型;
60+种医学、农牧领域模式动物及非常见动物样本;
60+种药物、农牧领域模式植物及非常见植物样本;
60+种细菌、真菌等微生物样本。
与100+所医院、研究所等单位建立深度合作;
合作文章累积影响因子300+,发表于多部医学、生物学、植物等领域期刊。
提供timsTOF HT、timsTOF Pro2、Orbitrap Astral、Orbitrap Exploris? 480、Q Exactive HF-X、Orbitrap Eclipse等多种质谱平台选择;
提供DIA、dDIA、LFQ、TMT等多种定量方法选择。
发表期刊:Oxidative Medicine and Cellular Longevity
影响因子:7.3
发表单位:首都医科大学中医药学院
发表时间:2022.03.18
样本类型 | 送样量 | |
动物组织 | 常规组织(脑、心、肝、脾、肺、肾、肌肉等柔软组织) | 10 mg |
坚硬组织(软骨、毛发) | 100 mg | |
植物组织 | 柔软组织(木本植物的叶、花等,草本植物,藻类,蕨类植物) | 200 mg |
坚硬组织(根、树皮、树枝,果实种子等) | 2 g | |
微生物 | 常见细菌、真菌菌体(菌体沉淀)、精细胞 | 30 μL |
细胞 | 悬浮/贴壁培养细胞(细胞计数/沉淀) | 2×106或20 μL |
液体类 | 血浆/血清(不去除高丰度) | 5 μL |
血浆/血清(去除高丰度-伯乐) | 100 μL | |
血浆/血清(去除高丰度-TOP2/TOP14) | 50 μL | |
血浆/血清(去除高丰度-DMB蛋白冠) | 50 μL | |
脑脊液(不去除高丰度) | 100 μL | |
脑脊液(去除高丰度-TOP2/TOP14) | 300 μL | |
卵泡液(不去高丰度) | 100 μL | |
卵泡液(去除高丰度-伯乐)、尿液,精液 | 1 mL | |
淋巴液、关节液、穿刺液、腹水 | 3 mL | |
唾液/泪液/乳汁 | 500 μL | |
培养基上清(不能使用含血清的培养基) | 5 mL | |
FFPE | 每片厚度10 μm,面积1.5×2 cm | 2-5片 |
其他 | 蛋白溶液(最佳Buffer是8M Urea) | 10 μg |
4D-蛋白质组学是在3D分离即保留时间(retention time)、质荷比(m/z)、离子强度(intensity)这三个维度的基础之上增加了第四个维度——离子淌度(mobility)的分离。正向气流携带离子进入逆向梯度电场(电场逐级增大),若气流速度与离子的迁移速率相等则离子相对于漂移管静止,即不同离子依其淌度差异,分布在不同电场强度的位置。离子截面越大,离子淌度越小,维持静止所需的电场强度越高,即稳定在高场区域。此时若逐渐降低电压,即实现扫描。
当物质的性质相似在色谱中共洗脱,或具备相同的质荷比在质谱中为同一簇离子,会导致色谱或质谱无法有效分离,很难达到更好的检测效果。离子淌度分离的增加解决了这一问题,对异构体有更大的区分能力。