Label-free定量(LFQ)蛋白质组使用液相色谱串联质谱(LC-MS/MS)直接对蛋白质酶解产生的肽段进行检测,无需特殊标记处理,通过比较不同样品中相应肽段的信号强度,对肽段对应的蛋白质进行相对定量。
不受样本个数限制;
适用于各种样本;
可检测微量样本;
可用于差异较大的样本之间的比较分析。
临床大队列样本的疾病分型、生物标志物发现;生理、病理及感染免疫的机制研究;药物的研发与药效评估
动植物的生长发育、遗传育种及生态保护研究;生物对环境的适应及胁迫抗逆的机制研究;营养与饲料成分的分析与优化
食品营养价值与品质的分析鉴定;产品成分的分析与优化;食品安全的提升
项目经验涵盖多物种、多组织器官类型及多疾病类型,包括:
100+种人类器官、组织、细胞及疾病类型;
60+种小鼠器官、组织、细胞及疾病类型;
60+种医学、农牧领域模式动物及非常见动物样本;
60+种药物、农牧领域模式植物及非常见植物样本;
60+种细菌、真菌等微生物样本。
与100+所医院、研究所等单位建立深度合作;
合作文章累积影响因子300+,发表于多部医学、生物学、植物等领域期刊。
提供timsTOF HT、timsTOF Pro2、Orbitrap Astral、Orbitrap Exploris? 480、Q Exactive HF-X、Orbitrap Eclipse等多种质谱平台选择;
提供DIA、dDIA、LFQ、TMT等多种定量方法选择。
发表期刊:Molecular Plant
影响因子:17.1
发表单位:中国科学院昆明植物研究所
发表时间:2019.12.05
样本类型 | 送样量 | |
动物组织 | 常规组织(脑、心、肝、脾、肺、肾、肌肉等柔软组织) | 10 mg |
坚硬组织(软骨、毛发) | 100 mg | |
植物组织 | 柔软组织(木本植物的叶、花等,草本植物,藻类,蕨类植物) | 200 mg |
坚硬组织(根、树皮、树枝,果实种子等) | 2 g | |
微生物 | 常见细菌、真菌菌体(菌体沉淀)、精细胞 | 30 μL |
细胞 | 悬浮/贴壁培养细胞(细胞计数/沉淀) | 2×106或20 μL |
液体类 | 血浆/血清(不去除高丰度) | 5 μL |
血浆/血清(去除高丰度-伯乐) | 100 μL | |
血浆/血清(去除高丰度-TOP2/TOP14) | 50 μL | |
血浆/血清(去除高丰度-DMB蛋白冠) | 50 μL | |
脑脊液(不去除高丰度) | 100 μL | |
脑脊液(去除高丰度-TOP2/TOP14) | 300 μL | |
卵泡液(不去高丰度) | 100 μL | |
卵泡液(去除高丰度-伯乐)、尿液,精液 | 1 mL | |
淋巴液、关节液、穿刺液、腹水 | 3 mL | |
唾液/泪液/乳汁 | 500 μL | |
培养基上清(不能使用含血清的培养基) | 5 mL | |
FFPE | 每片厚度10 μm,面积1.5×2 cm | 2-5片 |
其他 | 蛋白溶液(最佳Buffer是8M Urea) | 10 μg |
蛋白质非标记定量技术(Label-Free)是无需使用同位素标签的,只需分析大规模鉴定蛋白质时所产生的质谱数据,比较不同样品中相应肽段的信号强度,从而对肽段对应的蛋白质进行相对定量。Label-Free的技术优势就在于蛋白质不需要进行标记,所需样品总量少,耗费低,无样本数量限制,但是建议多次(三次以上)重复。