单细胞蛋白质组学（Signle-Cell Proteomics.SCP）技术正在以惊人的速度发展。结合高通量质谱分析，SCP使我们能够在单细胞水平上精确测量蛋白质表达，从而深入研究不同细胞类型及其亚群之间的微小差异。这项技术的进步不仅推动了我们对生命本质的认识，也为个性化医疗和精准诊断的未来铺平了道路。
为了进一步推动SCP技术的发展，深化对生命本质的理解，并推动个性化医疗与精准诊断的发展，我们推出了科研助力计划。
以下2篇单细胞蛋白质组学研究经典案例分享，供大家参考。
单细胞蛋白质组学揭示人卵母细胞的异质性[1]
研究目的：
通过单细胞蛋白质组学分析，研究人类卵母细胞成熟过程中的蛋白质表达差异，尤其是体外成熟（IVM）与体内成熟（IVO）卵母细胞的比较，以深入理解成熟机制，评估IVM卵母细胞的质量，并为辅助生殖技术中IVM技术的应用提供蛋白层面的评估。
研究策略：
样本收集：研究包括36个人体卵母细胞（12个GV期卵母细胞，12个IVM卵母细胞，12个IVO卵母细胞），来自13名捐赠者；
分析方法：单细胞蛋白质组学；
研究结果：
差异表达：IVM与IVO卵母细胞间存在45个差异表达的蛋白质。
异质性：IVM卵母细胞的蛋白质表达异质性高于IVO。
相关性：雌二醇水平与IVM卵母细胞的蛋白质表达异质性显著相关。
功能：差异蛋白质涉及关键生物学过程，对卵母细胞成熟和胚胎发育重要。
IVM卵母细胞质量：研究为评估IVM对卵母细胞质量的影响提供资源，深入研究成熟机制。
该研究的结果有助于深入理解IVM技术中卵母细胞成熟过程的分子机制，并可能为改善IVM卵母细胞的质量和临床应用提供科学依据。
单细胞蛋白质组学揭示毛细胞分化过程中蛋白质的动态变化[2]
研究目的：
探索内耳毛细胞（hair cells）在分化过程中丰富蛋白质的动态变化。毛细胞是负责听觉和平衡的感官细胞，它们在分化时会构建一个复杂的肌动蛋白（actin）细胞骨架，关注支持细胞（progenitors of vestibular hair cells）如何快速转变为具有立体毛（stereocilia）的毛细胞。
研究策略：
样本收集：E15小鸡的胞囊毛细胞和支持细胞
研究方法：单细胞蛋白质组学、单细胞转录组
研究结果：
研究者能通过单细胞蛋白质组学区分毛细胞和支持细胞。
单细胞蛋白质组学揭示了毛细胞分化过程中表达变化的蛋白质。
单细胞蛋白质组学数据揭示了单细胞转录组学可能遗漏的发育特征。
肌动蛋白单体结合蛋白TMSB4X在支持细胞中丰度较高，但在毛细胞分化时表达下降。
单细胞转录组分析显示，关键调节因子ATOH1激活时TMSB4X转录本下调，与蛋白质组学数据一致，支持肌动蛋白单体通过TMSB4X降解以促进毛束组装的理论模型。
该研究通过单细胞蛋白质组学分析，揭示了毛细胞发育过程中蛋白质表达水平的变化，为理解毛细胞的成熟和功能提供了新的视角。
皇家马德里中文官网致力于单细胞蛋白质组学研究，提供一体化解决方案，包括技术平台、数据分析服务和最新引入的4D质谱仪技术。通过将组织或器官中的细胞解离成细胞悬液，并利用细胞分选技术逐个分选细胞，对单个细胞进行质谱检测，分析和识别细胞内蛋白质组成和表达水平，进而深入了解细胞类型和状态。目前已实现对单个293T细胞3000+蛋白的检测深度，并进一步提供专业数据分析服务，助力研究人员解读单细胞蛋白质组学数据，使研究更加深入全面。
参考文章
[1] Guo Y, Cai L, Liu X, et al. Single-Cell Quantitative Proteomic Analysis of Human Oocyte Maturation Revealed High Heterogeneity in In Vitro–Matured Oocytes [J]. Molecular & Cellular Proteomics, 2022, 21(8).
[2] Zhu Y, Scheibinger M, Ellwanger D C, et al. Single-cell proteomics reveals changes in expression during hair-cell development [J]. eLife, 2019, 8.
